从“能看懂”到“有质感”，科研Figure排版怎么做？本期跟大家分享的是发表在 Nature 上的题目为 Non-genotoxic transplantation and in vivo selection through epitope editing 的研究论文的排版和配色！
科研配色拆解见: 跟着顶刊学配色 72 | Nature
Casirati, G., Cosentino, A., Freschi, M. et al. Non-genotoxic transplantation and in vivo selection through epitope editing. Nature 657, 262–274 (2026).
FIG. 1
(a) KIT ECD4与Fab-79D结合的结构模型及His378位点示意图。
(b) 利用碱基编辑将KIT H378R突变引入HSPCs，并通过流式细胞术检测Fab-79D结合。
(c) BCL11A增强子+58和+55位点的碱基编辑设计。
(d) KIT H378R和BCL11A双位点多重碱基编辑效率。
(e) 编辑后CD34⁺ HSPCs的表型分析。
(f) 不同干细胞和祖细胞亚群中的编辑结果分析。
(g–h) 单独或联合编辑后HbF表达及其与BCL11A编辑程度的关系。
(i–j) 单细胞基因分型及KIT、BCL11A多位点共编辑情况。
(k–l) Fab-79D抗体对多重编辑HSPCs的体外选择作用。
(m–n) Fab-79D处理前后HSPCs集落形成能力分析。
(o–p) 单个细胞克隆基因分型及Fab-79D选择后的等位基因组成分析。
FIG 2
(a) HSPCs基因组条形码标记及克隆追踪载体设计。
(b) KIT H378R编辑HSPCs与对照HSPCs在Fab-79D作用下的体外竞争性生长分析。
(c) NBSGW小鼠体内竞争性移植及Fab-79D筛选实验设计。
(d–e) 不同Fab-79D给药方案下人源HSPC移植及各类造血细胞组成分析。
(f) 不同造血细胞亚群中的选择性富集情况。
(g) 不同造血谱系中编辑细胞和对照细胞的绝对数量。
(h) 终点时骨髓来源红系和髓系集落的细胞组成。
(i–k) 骨髓及红系细胞中KIT H378R和BCL11A编辑效率。
(l) 红系细胞HbF表达分析。
(m–n) 不同造血细胞亚群的克隆性及条形码多样性分析。
FIG 3
(a–b) Fab-79D和SR-1与人KIT的结合及其对HSPC生长的抑制作用。
(c–d) 利用小鼠-人KIT嵌合蛋白进行抗体表位定位。
(e–i) SR-1结合表位的精细定位及KIT突变体验证。
(j–l) KIT野生型及突变体与SR-1或SCF的结合和功能分析。
(m) 利用碱基编辑构建KIT S123P突变。
(n–o) KIT S123P编辑HSPCs与对照HSPCs在SR-1作用下的体外竞争性生长分析。
(p–q) KIT S123P与BCL11A联合编辑HSPCs的体内SR-1选择实验及细胞组成分析。
(r) 不同SR-1剂量下KIT S123P编辑效率。
(s–t) 人源HSPC移植及不同造血谱系细胞输出分析。
FIG 4
(a–b) 采用Prime editing构建KIT D121L突变及BCL11A +58编辑。
(c–e) KIT与BCL11A多重Prime editing效率及等位基因组成分析。
(f) Prime editing后红系细胞HbF表达分析。
(g–h) 编辑后CD34⁺ HSPCs表型及不同祖细胞亚群中的编辑效率。
(i–j) SR-1对KIT D121L和BCL11A +58 Prime-edited HSPCs增殖及集落形成的影响。
(k–l) SR-1处理后单克隆基因分型及等位基因分布分析。
(m–o) NBSGW小鼠体内SR-1给药及人源HSPC移植后的植入情况和造血细胞组成。
(p–q) 体内KIT表位编辑结果及不同等位基因编辑状态的流式分析。
(r) 骨髓及不同造血细胞亚群中的KIT D121L和BCL11A +58编辑效率。
FIG 5
(a) 体内造血细胞替换实验设计。
(b–d) SR-1预处理后，不同编辑HSPCs在骨髓中的竞争性植入及造血细胞组成分析。
(e) 终点时KIT D121L和BCL11A +58编辑效率。
(f) 骨髓来源红系细胞分化后的HbF表达。
(g–h) 人源移植物的克隆性及条形码多样性分析。
(i) SCD患者来源HSPCs的KIT表位和BCL11A联合编辑及体外筛选实验设计。
(j) 不同Fab-79D或SR-1浓度下KIT和BCL11A编辑效率。
(k–l) 抗KIT抗体处理后SCD来源红系细胞的血红蛋白组成及HbF表达分析。
