为什么你的Figure总差点意思？问题可能出在排版。
本期跟大家分享的是发表在 Cell 上的题目为 Viral protease-initiated lytic cell death as a universal antiviral mRNA therapy 的研究论文的排版和配色！
科研配色拆解见: 跟着顶刊学配色 85 | Cell
Li L, Yan X, Wang H ...
Viral protease-initiated lytic cell death as a universal antiviral mRNA therapy
Cell, 2026; 189, 5396-5410.e8
FIG. 1
设计VIDA，实现对HAV感染细胞的选择性精准杀伤
(A) VIDA概念及构建策略示意图。
(B–E) HAV 3C蛋白酶及其活性突变体与VIDA或耐蛋白酶突变体共同表达后的细胞死亡及VIDA剪切分析。
(B) 活细胞Annexin V成像。
(C–D) LDH释放及细胞内ATP水平检测。
(E) VIDA全长和剪切产物的蛋白表达分析。
(F–I) HAV感染Huh7.5.1细胞后VIDA处理对病毒复制和细胞死亡的影响，包括病毒VP1、HAV RNA、Annexin V及LDH检测。
(J) HAV感染细胞中VIDA表达及线粒体形态变化分析。
FIG 2
VIDA mRNA-LNP具有良好的体内外安全性
(A) VIDA安全性评价的实验流程。
(B–C) VIDA表达细胞的转录组分析及焦亡相关基因表达。
(D) VIDA mRNA-LNP体内给药后肝脏中的VIDA蛋白表达。
(E) 重复给药后小鼠体重变化。
(F) 肝组织H&E染色及组织学评价。
(G) 血清ALT和AST水平检测。
(H) 外周血细胞计数及主要血液学指标分析。
FIG 3
LNP递送VIDA mRNA在HAV感染小鼠中具有显著的抗病毒和肝保护作用
(A) HAV感染小鼠及VIDA mRNA-LNP治疗的实验流程。
(B) 小鼠粪便中HAV病毒脱落水平动态变化。
(C–D) 肝组织中HAV RNA及病毒RNA原位杂交检测。
(E) 血清ALT和AST水平检测。
(F–G) 肝组织H&E染色及病理损伤评分。
(H) HAV感染肝组织中cleaved caspase-3、VIDA和HAV VP1的免疫荧光分析。
FIG 4
VIDA mRNA在肝脏免疫细胞中诱导协同抗病毒免疫警报，并增强T细胞抗病毒活性
(A) VIDA处理后HAV感染肝组织抗病毒信号通路分析。
(B–C) 肝脏单细胞RNA测序及主要细胞群组成分析。
(D) 肝脏免疫细胞上调基因的GO富集分析。
(E) 不同肝脏细胞群抗病毒相关通路活性分析。
(F) VIDA处理前后肝脏细胞间配体-受体通讯网络分析。
(G) T细胞亚群的单细胞分析。
(H) CD8⁺ T细胞抗病毒及活化相关信号通路分析。
FIG 5
SARS-CoV-2 VIDA的构建及功能验证
(A) SARS-CoV-2 VIDA及其突变体构建示意图。
(B) SARS-CoV-2 NSP5蛋白酶对VIDA的体外剪切验证。
(C–E) NSP5与VIDA或突变体共同表达后的细胞死亡、LDH释放及VIDA剪切分析。
(F) SARS-CoV-2感染细胞中VIDA对病毒N蛋白表达的影响。
(G) VIDA片段表达对SARS-CoV-2病毒RNA复制的影响。
FIG 6
SARS-CoV-2 VIDA的构建及功能验证
(A) SARS-CoV-2 VIDA及其突变体构建示意图。
(B) SARS-CoV-2 NSP5蛋白酶对VIDA的体外剪切验证。
(C–E) NSP5与VIDA或突变体共同表达后的细胞死亡、LDH释放及VIDA剪切分析。
(F) SARS-CoV-2感染细胞中VIDA对病毒N蛋白表达的影响。
(G) VIDA片段表达对SARS-CoV-2病毒RNA复制的影响。
FIG 7
AI指导的序列进化获得具有增强抗病毒活性的蛋白酶响应型VIDA
(A–B) 基于EVE模型的AI序列生成、筛选及VIDA优化流程。
(C) 进化评分对候选序列剪切结果的预测能力评估。
(D–E) 天然序列与AI生成序列的分布、聚类及序列特征分析。
(F) 基于FRET的候选肽蛋白酶剪切筛选体系。
(G) AI生成候选肽对SARS-CoV-2 NSP5剪切敏感性的体外筛选。
(H) AI优化VIDA候选物在细胞中的焦亡诱导能力筛选。
(I) AI优化VIDA候选物对SARS-CoV-2复制的抑制作用。
(J) 野生型肽与最佳AI候选肽的NSP5剪切动力学比较。
示意图
研究总结
Gasdermin（GSDM）介导的细胞焦亡具有强大的免疫效应，但其抗病毒潜力尚未得到充分利用。研究者基于GSDM的模块化结构和mRNA疫苗技术，开发了一种病毒蛋白酶启动的裂解性细胞死亡（VID）mRNA治疗平台。
通过在GSDMD中引入针对特定病毒蛋白酶的剪切序列，研究者构建了VID激活因子（VIDAs），使病毒蛋白酶成为“开关”，仅在病毒感染细胞中激活GSDMD并诱导裂解性细胞死亡。
以甲型肝炎病毒（HAV）为模型，LNP递送的VIDA mRNA能够在体内显著抑制病毒复制和排出，并通过“杀伤+预警（kill-and-alert）”机制，在清除感染细胞的同时激活旁观者免疫，从而减轻肝脏损伤。
进一步研究表明，该策略同样适用于寨卡病毒（ZIKV）和SARS-CoV-2。此外，研究者利用生成式人工智能设计SARS-CoV-2主蛋白酶的新型剪切序列，获得了具有更强抗病毒活性的优化VIDA。
总体而言，该研究建立了一种可通过更换病毒蛋白酶识别序列进行模块化设计的广谱抗病毒mRNA平台，为应对不同病毒感染提供了新的治疗策略。
